Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms