Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIOK2Q9BVS4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIOK2Q9BVS4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIOK2Q9BVS4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIOK2Q9BVS4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms