Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SORT1Q99523 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms