Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL4Q96C24 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms