Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEO1Q92859 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms