Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms