Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGNBQ7Z5D8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms