Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUFY3Q7L099 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RUFY3Q7L099 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms