Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRIG3Q6UXM1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRIG3Q6UXM1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms