Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms