Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms