Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms