Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms