Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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