Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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