Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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