Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms