Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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