Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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