Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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