Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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