Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms