Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms