Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMX1Q04741 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EMX1Q04741 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EMX1Q04741 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EMX1Q04741 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EMX1Q04741 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EMX1Q04741 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EMX1Q04741 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EMX1Q04741 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EMX1Q04741 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMX1Q04741 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMX1Q04741 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMX1Q04741 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms