Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms