Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms