Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLD1P28340 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLD1P28340 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms