Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms