Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF1BP20333 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms