Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms