Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms