Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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TIMM17BO60830 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TIMM17BO60830 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TIMM17BO60830 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TIMM17BO60830 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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TIMM17BO60830 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TIMM17BO60830 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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