Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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