Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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