Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms