Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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