Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCF2Q9UG63 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms