Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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