Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms