Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms