Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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