Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC38Q502W7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms