Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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