Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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