Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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