Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms