Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPOP42166 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPOP42166 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPOP42166 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms