Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-FP30511 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms