Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms