Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SPRR1BP22528 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms